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evry-paris-saclay/2023-m2cns-rd-ChaineDeValeurs

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2023-m2cns-rd-ChaineDeValeurs

Contexte

Le but de ce projet est de développer une solution basée sur des dispositifs connectés pour améliorer la gestion et le recyclage des produits de santé jetables.

Les quantités de produits plastiques utilisés dans les activités de santé, tels que les seringues, les poches de perfusion et les gants chirurgicaux, ont atteint plus de 36 milliards d'euros dans le monde en 2020 et devraient atteindre 55 milliards d'euros d'ici 2025, selon le Conseil de Recyclage des Plastiques de Santé. La plupart de ces produits sont éliminés dans des décharges ou incinérés, même si une partie importante est non contaminée et donc recyclable. Les solutions de dispositifs connectés ont le potentiel d'impact sur la chaîne de valeur de ces produits en améliorant leur manipulation tout en garantissant la sécurité et l'efficacité des processus.

La première étape consiste à mener une étude sur les domaines où les technologies de l'Internet des Objets (IoT) pourraient améliorer la manipulation des produits liés à la santé. Cela inclut des aspects tels que la gestion des stocks, les conteneurs de déchets intelligents, la gestion des déchets et la surveillance des conditions de stérilisation des équipements. Ensuite, nous somme chargé de concevoir et de mettre en œuvre une solution concrète basée sur des dispositifs connectés qui répond à l'un des domaines identifiés.

Fonctionnement Système de Tri Automatisé des Déchets

Lorsque notre système est activé, une photo est capturée depuis une caméra IP que nous avons intégrée. Ensuite, notre modèle d'intelligence artificielle analyse cette photo et lui attribue une classe correspondant à l'objet détecté. En fonction de la classe attribuée, un signal est envoyé à l'ESP 2, un microcontrôleur, qui se charge de positionner l'aiguillage approprié pour diriger le déchet vers le bon conteneur. Une fois l'aiguillage correctement positionné, un signal de confirmation est renvoyé à notre plateforme centrale.

Cette plateforme, à son tour, envoie un signal à l'ESP 1 pour déclencher la chute du déchet dans le conteneur correspondant situé tout en bas. Pendant tout ce processus, notre ESP 3 est activement impliqué. Il est équipé d'un capteur à ultrasons qui surveille en permanence le niveau des déchets dans les différents conteneurs. Dès qu'un changement significatif est détecté, un signal est envoyé à la plateforme centrale pour confirmer l'arrivée du déchet.

Ce système assure un tri efficace et automatisé des déchets, minimisant ainsi les interventions humaines tout en garantissant une gestion optimale des déchets.

Le flux de notre systeme ci-dessous:

flowchart TD;
    camera--image-->c{node.RED};
    c{node.RED}--Position-->ESP_1;
    ESP_1-->Servo_1;
    ESP_1-->Servo_2;
    ESP_1-->Servo_3;
    ESP_1-->Servo_4;
    ESP_1--confirmation-->c{node.RED};
    c{node.RED}--trigger-->ESP_2;
    ESP_2-->Servo_5;
    ESP_2-->Servo_6;
    censor-->ESP_3;
    ESP_3--confirmation-->c{node.RED};
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Pour plus de détails, veuillez consulter le rapport et la présentation.

Installation et Configuration

Installation de Node-RED avec Docker

Ce guide explique comment installer Node-RED en utilisant Docker et comment ajouter des bibliothèques supplémentaires à Node-RED.

Prérequis

  • Docker Desktop doit être installé sur votre système. Vous pouvez télécharger Docker Desktop depuis leur site officiel.
  • un server MTTQ type mosquitto

Installation de Node-RED

  1. Ouvrez une fenêtre de terminal ou une invite de commande.

  2. Exécutez la commande suivante pour démarrer Node-RED dans un conteneur Docker :

docker run -v /chemin/vers/mon/repertoire:/data -p 1880:1880 nodered/node-red

Cette commande Docker est utilisée pour exécuter Node-RED dans un conteneur Docker tout en montant un volume pour enregistrer les données dans un répertoire spécifié sur votre système hôte. Voici une explication détaillée :

  • docker run: Cette commande est utilisée pour exécuter un conteneur Docker.
  • -v /chemin/vers/mon/repertoire:/data: Cet argument monte un volume en reliant un répertoire sur votre système hôte (le répertoire de votre choix, tel que /chemin/vers/mon/repertoire) à un répertoire dans le conteneur Docker (ici, /data). Cela permet à Node-RED d'accéder et d'enregistrer des données dans le répertoire spécifié sur votre système hôte.
  • -p 1880:1880: Cet argument expose le port 1880 de Node-RED dans le conteneur Docker sur le port 1880 de votre machine hôte, permettant ainsi d'accéder à l'interface utilisateur de Node-RED depuis votre navigateur web.
  • nodered/node-red: C'est l'image Docker officielle de Node-RED que vous souhaitez exécuter dans votre conteneur Docker.
  1. Ouvrez votre navigateur web et accédez à l'adresse http://localhost:1880 pour accéder à l'interface utilisateur de Node-RED.

Ajout de bibliothèques à Node-RED

Une fois que Node-RED est en cours d'exécution, vous pouvez ajouter des bibliothèques supplémentaires à l'aide de l'interface de gestion des paquets de Node-RED.

  1. Dans votre navigateur web, accédez à l'adresse http://localhost:1880.

  2. Cliquez sur l'icône de menu en haut à droite de la fenêtre, puis sélectionnez "Manage palette".

manage

  1. Dans l'onglet "Install", vous pouvez rechercher les bibliothèques supplémentaires à installer. Pour chaque bibliothèque mentionnée dans ce guide, recherchez son nom et cliquez sur "Install".

install

  1. Une fois l'installation terminée, redémarrez Node-RED pour que les changements prennent effet.

Bibliothèques à installer

Assurez-vous d'installer les bibliothèques suivantes à l'aide de l'interface de gestion des paquets de Node-RED :

  • node-red-contrib-browser-utils (version 0.0.11)
  • node-red-contrib-image-output (version 0.6.4)
  • node-red-contrib-image-tools (version 2.0.4)
  • node-red-contrib-teachable-machine (version 1.4.1)
  • node-red-contrib-tf-function (version 0.1.1)
  • node-red-contrib-tf-model (version 0.1.12)
  • node-red-contrib-ui-button_state (version 0.2.2)
  • node-red-dashboard

Installation de Mosquitto sur Windows

Téléchargement de l'installateur

  1. Téléchargez l'installateur de Mosquitto depuis le site officiel de Mosquitto.

Installation de Mosquitto

  1. Exécutez l'installateur téléchargé en double-cliquant sur le fichier téléchargé.

  2. Suivez les instructions à l'écran pour installer Mosquitto sur votre système il est recommedé d'installer sur un autre disque que le C: pour pouvoir modifier le fichier mosquitto.conf.

3.modifier le fichier mosquitto.conf comme suit:

# Paramètres généraux
pid_file mosquitto.pid
persistence true
persistence_location mosquitto.db
log_dest file D:\mosquitto\mosquitto.log

# Définition du listener
listener 1883

# Autoriser les connexions anonymes
allow_anonymous true

Lancement de Mosquitto

  1. Après l'installation, ouvrez un terminal ou une invite de commande.

  2. Exécutez la commande suivante pour démarrer le service Mosquitto :

net start mosquitto
  1. Mosquitto sera maintenant en cours d'exécution sur votre système.

Configuration des nœuds Node-RED avec MQTT

Pour configurer les nœuds Node-RED pour une utilisation avec MQTT, veuillez suivre ces étapes simples :

  1. Ouvrez votre environnement Node-RED.

Broker

  1. selectionner les nœuds MQTT a configurer.

out

  1. Pour configurer un nœud MQTT de réception, double-cliquez sur le nœud , puis spécifiez les paramètres du broker MQTT auquel vous souhaitez vous connecter.

in

  1. Pour configurer un nœud MQTT d'émission, suivez la même procédure et définissez les paramètres de publication, y compris le sujet (topic) sur lequel vous souhaitez publier.

  2. Assurez-vous de définir les autorisations et les paramètres de sécurité appropriés pour votre broker MQTT si nécessaire.

  3. Une fois la configuration terminée, déployez vos modifications pour les appliquer.

Veillez à consulter la documentation de Node-RED et de MQTT pour des instructions spécifiques à votre environnement et à vos cas d'utilisation.

  1. pour surveiller les echange MTTQ nous avons utiliser MTTQ Explorer

MTTQ EXplorer

Arduino

Instructions d'installation du code Arduino

Le code fourni pour ce projet sera destiné à être utilisé sur trois cartes ESP32 distinctes, chacune remplissant un rôle spécifique dans le système de gestion des déchets de santé.

ESP1 - Gestion de la jetée des déchets

Ce code sera chargé sur la première carte ESP32 et sera responsable de la gestion de la jetée des déchets. Il s'occupera d'enclancher le mécanisme de jetée et de transmettre les informations nécessaires a la platform IoT.

ESP2 - Gestion de l'aiguillage

Sur la deuxième carte ESP32, le code sera chargé pour gérer l'aiguillage des déchets. Cette carte recevra les informations de la Platform IoT concernant le type de déchet jeté et dirigera ensuite le déchet vers le bon conteneur en fonction de sa catégorie.

ESP3 - Gestion de l'arrivée des déchets

Enfin, sur la troisième carte ESP32, le code sera chargé de gérer l'arrivée des déchets dans le réceptacle final. Cette carte s'assurera que les déchets sont correctement reçus et enregistrés dans le système.

Configuration des branchements matériels

Les détails spécifiques sur la configuration des branchements matériels seront fournis dans le code Arduino de chaque ESP. Cependant, voici une vue d'ensemble générale des composants matériels nécessaires et de leur configuration typique :

  • ESP1 : Actionneurs de jetée de déchets a base de servomoteurs.
  • ESP2 : Aiguillage a l'aide de servomoteurs.
  • ESP3 : Capteurs de détection Ultrason.

Le code de chaque ESP sera fourni de manière générique, ce qui permettra aux utilisateurs de l'adapter en fonction de leur propre configuration matérielle et de leurs besoins spécifiques.

exemple de branchement sur l'ESP_2

branchement ESP_2

Plateforme IoT avec Node-RED

Nous avons mis en place une plateforme IoT basée sur Node-RED pour centraliser et gérer notre projet de gestion des déchets de santé. Cette plateforme permet de coordonner les différentes étapes du processus, depuis la détection et la classification des déchets jusqu'à leur traitement final.

Fonctionnalités Principales :

  • Interface Visuelle Intuitive : Node-RED offre une interface visuelle intuitive, qui nous permet de créer et de gérer facilement les flux de données et les interactions entre les différents composants de notre système.

  • Intégration des Dispositifs IoT : Nous utilisons Node-RED pour intégrer les divers dispositifs IoT utilisés dans notre projet, tels que les capteurs de détection de déchets, les actionneurs d'aiguillage, les servomoteurs de la plateforme mobile, les caméras IP pour la prise de photos, et les ESP pour le contrôle des opérations.

  • Traitement des Données en Temps Réel : Node-RED nous permet de traiter les données en temps réel en provenance des capteurs et des caméras. Par exemple, nous utilisons des nœuds de traitement d'images pour analyser les photos des déchets et des nœuds de machine learning pour classifier les déchets en fonction de leur catégorie.

  • Gestion des Flux de Travail : Node-RED nous permet de définir et de gérer les flux de travail de notre système, en orchestrant les différentes étapes du processus de gestion des déchets. Par exemple, nous configurons des scénarios pour déclencher l'aiguillage des déchets en fonction de leur catégorie, et pour actionner la plateforme mobile pour le largage des déchets dans le réceptacle final.

Utilisation dans notre Projet :

Dans notre projet, la plateforme Node-RED joue un rôle crucial dans la coordination des opérations de gestion des déchets de santé :

  • Détection et Classification des Déchets : Lorsqu'un déchet est déposé sur la plateforme mobile, une photo est prise à l'aide d'une caméra IP et analysée par notre modèle de machine learning. Node-RED orchestre ce processus en déclenchant la capture de la photo, l'analyse par le modèle ML, et la classification du déchet en fonction de sa catégorie.

  • Aiguillage des Déchets : Une fois que le déchet est classifié, Node-RED envoie un signal à l'ESP2 pour ajuster l'aiguillage en fonction de la catégorie du déchet.

  • Largage des Déchets : Après que l'aiguillage est en place, Node-RED envoie un signal à l'ESP1 pour actionner la plateforme mobile à l'aide de servomoteurs, permettant ainsi le largage du déchet dans le réceptacle final.

  • Traitement Final des Déchets : Le réceptacle final est équipé d'un capteur ultrasonique qui détecte le passage du déchet. Lorsque le déchet est détecté, l'ESP3 envoie un signal à la plateforme via Node-RED, indiquant que le déchet a été traité avec succès.

Flow Node

Simulation du Flux

Machine Learning

Instructions pour la mise en place de l'environnement ML

Prérequis

  • Assurez-vous d'avoir Python 3.x installé sur votre machine.
  • Installez la bibliothèque tensorflow à l'aide de la commande suivante : pip install tensorflow

Configuration de l'environnement de développement

  • Clonez ce dépôt : git clone https://github.com/evry-paris-saclay/2023-m2cns-rd-ChaineDeValeurs.git

  • Ouvrez le fichier Jupyter Notebook ou le script Python dans votre environnement de développement, par exemple : jupyter notebook mon_notebook.ipynb

  • Modifiez le répertoire de données (data_dir) dans le script pour refléter le chemin vers votre jeu de données médicales.

Ces étapes devraient vous permettre de configurer l'environnement nécessaire pour exécuter le code sans problème.

Configuration des données, des modèles ML, et des fonctions pour l'entraînement des modèles

Chargement des données

  • Assurez-vous que les images médicales sont organisées dans des répertoires par classe. Modifiez la variable data_dir dans le script pour pointer vers le répertoire racine de vos données.

Prétraitement des images

  • Les images sont redimensionnées à une taille de 100x100 pixels et normalisées entre 0 et 1.

Division des données

  • Les données sont divisées en ensembles d'entraînement, de validation et de test.

Configuration du modèle

  • Le modèle CNN est défini dans le script avec des couches de convolution, de pooling et de neurones denses. La dernière couche utilise une fonction d'activation softmax pour la classification multi-classes.

Compilation du modèle

  • L'optimiseur 'adam' et la fonction de perte 'sparse_categorical_crossentropy' sont utilisés pour la compilation du modèle.

Entraînement du modèle

  • Le modèle est entraîné avec 10 époques sur les données d'entraînement, en utilisant les données de validation pour le suivi.

Évaluation du modèle

  • Le modèle est évalué sur les données de test, et la précision du test est affichée.

Sauvegarde et chargement du modèle

  • Le modèle est sauvegardé au format h5 après l'entraînement. Vous pouvez charger le modèle sauvegardé ultérieurement à l'aide de la fonction de chargement.

Prédiction sur une nouvelle image

  • Utilisez le modèle entraîné pour prédire la classe d'une nouvelle image en ajustant le chemin d'accès de l'image dans la variable img_path.

Fonctionnement du Système

Dans cette démonstration, après le chargement de notre modèle, nous lui avons présenté une image représentant un tube à essai, et le modèle a réussi à la reconnaître avec succès.

Image fournie

Courbe d'entraînement

Reponse du modele

Courbe d'entraînement

Tests et Analyses de Performance

Suivi de l'Entraînement du Modèle

Pendant l'entraînement du modèle, nous surveillons les performances en termes de précision et de perte. Nous utilisons la bibliothèque matplotlib pour visualiser ces métriques au fil des époques. Voici comment le faire dans votre code Python :

# Tracé de la courbe d'entraînement de la précision
plt.plot(history.history['accuracy'], label='Train Accuracy')
plt.plot(history.history['val_accuracy'], label='Validation Accuracy')
plt.xlabel('Epoch')
plt.ylabel('Accuracy')
plt.ylim([0, 1])
plt.legend(loc='lower right')
plt.show()

# Tracé de la courbe d'entraînement de la perte
plt.plot(history.history['loss'], label='Train Loss')
plt.plot(history.history['val_loss'], label='Validation Loss')
plt.xlabel('Epoch')
plt.ylabel('Loss')
plt.legend(loc='upper right')
plt.show()

Ces courbes permettent de visualiser la progression de la précision et de la perte pendant l'entraînement du modèle.

Accuracy

Courbe d'entraînement

Loss

Courbe d'entraînement

Affichage de la Matrice de Confusion

Pour évaluer les performances du modèle, nous utilisons la matrice de confusion, qui montre le nombre de vrais positifs, de vrais négatifs, de faux positifs et de faux négatifs. Vous pouvez afficher la matrice de confusion en utilisant le code suivant dans votre script Python ou Jupyter Notebook :

from sklearn.metrics import confusion_matrix
import seaborn as sns

# Évaluation du modèle
test_loss, test_acc = model.evaluate(x_test, y_test)
print(f"Test Accuracy: {test_acc}")

# Obtenez les probabilités des classes pour chaque échantillon de test
y_probs = model.predict(x_test)

# Obtenez les classes prédites en choisissant l'indice avec la probabilité la plus élevée
y_pred = np.argmax(y_probs, axis=1)

# Calcul de la matrice de confusion
conf_matrix = confusion_matrix(y_test, y_pred)

# Tracé de la matrice de confusion avec seaborn
plt.figure(figsize=(8, 6))
sns.heatmap(conf_matrix, annot=True, fmt='g', cmap='Blues', xticklabels=classes, yticklabels=classes)
plt.xlabel('Predicted labels')
plt.ylabel('True labels')
plt.title('Confusion Matrix')
plt.show()

Assurez-vous d'avoir installé Seaborn en exécutant pip install seaborn si vous ne l'avez pas déjà fait.

Matrice de Confusion

Calcul du Rappel et de la Précision

Pour évaluer plus en détail les performances du modèle, nous calculons le rappel (recall) et la précision (precision) en utilisant sklearn.metrics.recall_score et sklearn.metrics.precision_score. Vous pouvez intégrer le code suivant dans votre script Python ou Jupyter Notebook :

from sklearn.metrics import recall_score, precision_score

# ... Votre code existant ...

# Évaluation du modèle
test_loss, test_acc = model.evaluate(x_test, y_test)
print(f"Test Accuracy: {test_acc}")

# Obtenez les probabilités des classes pour chaque échantillon de test
y_probs = model.predict(x_test)

# Obtenez les classes prédites en choisissant l'indice avec la probabilité la plus élevée
y_pred = np.argmax(y_probs, axis=1)

# Calcul du rappel (recall)
recall = recall_score(y_test, y_pred, average='weighted')
print(f"Recall: {recall}")

# Calcul de la précision (precision)
precision = precision_score(y_test, y_pred, average='weighted')
print(f"Precision: {precision}")

Dans ce code, recall_score et precision_score sont utilisés pour évaluer le rappel et la précision en considérant les vraies étiquettes (y_test) et les prédictions du modèle (y_pred). L'argument average='weighted' spécifie l'utilisation de la moyenne pondérée pour traiter les cas où les classes ne sont pas équilibrées de la même manière. Vous pouvez ajuster l'argument average en fonction de vos besoins spécifiques.

Rappel et Précision

F1 Score

Pour calculer le F1 Score en utilisant sklearn.metrics.f1_score, vous pouvez ajouter le code suivant à votre script Python :

from sklearn.metrics import f1_score

# ... Votre code existant ...

# Évaluation du modèle
test_loss, test_acc = model.evaluate(x_test, y_test)
print(f"Test Accuracy: {test_acc}")

# Obtenez les probabilités des classes pour chaque échantillon de test
y_probs = model.predict(x_test)

# Obtenez les classes prédites en choisissant l'indice avec la probabilité la plus élevée
y_pred = np.argmax(y_probs, axis=1)

# Calcul du F1 Score
f1 = f1_score(y_test, y_pred, average='weighted')
print(f"F1 Score: {f1}")

Dans ce code, la fonction f1_score est utilisée pour calculer le F1 Score en comparant les vraies étiquettes (y_test) avec les prédictions du modèle (y_pred). Comme pour le rappel et la précision, l'argument average='weighted' est utilisé pour prendre en compte le déséquilibre des classes. Vous pouvez ajuster l'argument average selon vos besoins spécifiques.

F1 Score

Courbes ROC-AUC

Si vous souhaitez afficher une courbe ROC pour chaque classe dans un problème de classification multi-classes, vous pouvez utiliser la bibliothèque matplotlib pour le tracé. Cependant, il est important de noter que la courbe ROC n'est généralement pas utilisée dans des problèmes de classification multi-classes de manière directe. Plutôt, on calcule les courbes ROC pour chaque classe individuelle et les affiche séparément.

Voici comment vous pouvez le faire dans votre script Python :

from sklearn.metrics import roc_curve, auc
import matplotlib.pyplot as plt

# ... Votre code existant ...

# Évaluation du modèle
test_loss, test_acc = model.evaluate(x_test, y_test)
print(f"Test Accuracy: {test_acc}")

# Obtenez les probabilités des classes pour chaque échantillon de test
y_probs = model.predict(x_test)

# Tracé des courbes ROC pour chaque classe
plt.figure(figsize=(8, 6))

for i in range(len(classes)):
    fpr, tpr, _ = roc_curve(y_test == i, y_probs[:, i])
    roc_auc = auc(fpr, tpr)

    plt.plot(fpr, tpr, label=f'{classes[i]} (AUC = {roc_auc:.2f})')

plt.plot([0, 1], [0, 1], linestyle='--', color='gray', label='Random')
plt.xlabel('False Positive Rate')
plt.ylabel('True Positive Rate')
plt.title('ROC Curve for Each Class')
plt.legend(loc='lower right')
plt.show()

Dans ce code, vous itérez sur chaque classe, calculez les valeurs de faux positif (fpr) et vrai positif (tpr), puis tracez la courbe ROC pour chaque classe. La légende de la courbe inclut également l'AUC (aire sous la courbe) pour chaque classe. La ligne en pointillés représente la ligne de référence aléatoire.

Courbes ROC-AUC

Dataset

Ce dataset a été obtenu dans le cadre du projet Medical Waste Treating 4.0, financé par la région de Toscane. L'objectif principal de ce jeu de données est de servir de ressource précieuse pour le développement et le test de méthodes de vision par ordinateur pour le tri initial des déchets médicaux.

Détails de l'acquisition

Le jeu de données a été capturé à l'aide d'une caméra OAK-D avec les spécifications techniques disponibles ici.

Structure des échantillons

Chaque échantillon du jeu de données est composé de trois images :

  • Image RVB : Résolution de 1920 x 1080
  • Image de droite (Paire stéréo) : 640 x 400 en niveaux de gris
  • Image de gauche (Paire stéréo) : 640 x 400 en niveaux de gris

Exemples de noms de fichiers :

  • timestamp.jpg : Image RVB
  • timestamp_r.png : Image de droite de la paire stéréo
  • timestamp_l.png : Image de gauche de la paire stéréo

Catégories

Le jeu de données comprend les catégories de déchets médicaux suivantes :

  • gaze
  • paire de gants en latex
  • paire de gants en nitrile
  • paire de gants chirurgicaux
  • gant unique en latex
  • gant unique en nitrile
  • gant unique chirurgical
  • calotte médicale
  • lunettes médicales
  • paire de couvre-chaussures
  • couvre-chaussure unique
  • tube à essai
  • sac d'urine

Attribution

Le jeu de données est mis à disposition sous la licence Creative Commons Attribution 4.0 International.

Veuillez citer le jeu de données de manière appropriée si vous l'utilisez dans votre travail.

Encadrant

  • Hamidi Massinissa

Auteurs

  • Laib Ramy
  • Saraoui Keltouma

About

No description, website, or topics provided.

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

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